1984年10月，区委同意设立中共杨浦区委党史资料征集小组。次年1月，同意建立中共杨浦区委党史资料征集办公室（简称党史办），聘用了一批离退休老领导老同志开展工作，1996年8月起，区委借用了个别在职干部充实党史办力量；1988年10月，区委同意设立区地方志编纂委员会办公室（简称方志办），也借聘了一些老同志开展工作。党史办、方志办均为临时机构。

2003年1月，区委决定成立上海市杨浦区史志编纂办公室（简称史志办），是党史和方志合一的正处级单位。2012年6月，上海市杨浦区史志编纂办公室变更为中共上海市杨浦区委党史研究室（上海市杨浦区地方志办公室），施行合署办公，即“一套班子、两块牌子”的组织形式，下设编研科和秘书科2个科室。

2019年7月，中共上海市杨浦区委机构编制委员会批复同意调整区委党史研究室（区地方志办公室）内设机构设置等事项。调整后，区委党史研究室设党史科、综合科，合署办公，区地方志办公室设方志科。